http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_web_hosting_control_panels
adresinde tüm hosting kontrol panellerin karşılaştırma tablosunu bulabilirsiniz.
Ancak ben burada kendi tecrübelerime dayanarak yorum yapacağım. Windows web sunucuda tüm işlemler sunucuya uzak masa üstünden bağlanılarak IIS üzerinden de yapılabilir ancak işlemler açısından size hız ve kolaylık kazandırsın isterseniz Windows üzerinde çalışan en sorunsuz panel kuşkusuz Parallels Plesk Panel ‘dir.
Bunun haricinde birçok ücretsiz kontrol panel de bulunmaktadır ancak gereksinim duyduğunuz tüm işlemler Plesk üzerinden oldukça kolay ve hızlı bir şekilde yapılabilmektedir.
Kurulum esnasında Plesk i Apache ve Mysql üzerine kurmanızı tavsiye ederim bu sayede ileride Plesk Panel üzerinde yapılan işlemlerde sorun çıkması ve hata alınması halinde kendiniz de manuel olarak düzeltmeler yapabilirsiniz.
Windows web sunucu üzerinde çalışan Plesk Panelin tek bir dezavantajı bulunmaktadır eğer maillerinizi de aynı sunucudan çalıştırıyorsanız ve Plesk ile birlikte gelen Mail Enable Standard Yazılımını kullanırsanız iki küçük sorun yaşayabilirsiniz.
1- Webmail üzerinde (Atmail veya Horde) Sent klasöründeki mailleri Mail Enable Standard Edition ile göremeyebilirsiniz.
2- Mail Enable Standard üzerinde domain başına günlük mail gönderim sayısını limitleyemezsiniz. Yani spam mail gönderen kullanıcıları loglardan ve mail kuyruğundan tespit etmeye çalışırken mail server ınızı kısa süreli kesintiye uğrayabilir.
Demo : http://www.parallels.com/products/plesk/
Ancak Linux üzerinde durum farklıdır. Bununla ilgili, Linux web sunucu üzerinde hosting kontrol paneli seçimi makalesine bakabilirsiniz.